หลักสูตรวิศวกรรมชีวภาพ มจธ. มีความร่วมมือที่เข้มแข็งกับสถาบันทางการแพทย์ชั้นนำในประเทศไทย และองค์กรชั้นนำระดับนานาชาติ ได้แก่
รายชื่อหน่วยงาน/มหาวิทยาลัย
ระดับชาติ
- ภาควิชาเคมี คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
- ภาควิชาชีวเคมี คณะวิทยาศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
ระดับนานาชาติ
- Osaka University
- Taipei Medical University
- Kanazawa University
- Shibuya Kogyo, Co. Ltd.
- Queensland University of Technology
- Institute for Theoretical Chemistry, University of Vienna, Austria
- Center for Brain Research, Medical University of Vienna, Austria
